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1、申请：申请人向分中心提出正式申请，领取《有机shipin认证申请表》和交纳申请费。
2、预审并制定初步的检查计划：分中心对申请人预审，认证中心根据分中心提供的项目情况，估算检查时间，制定初步检查计划和估算认证费用
3、签订有机shipin认证检查合同：申请人确认《受理通知书》后，与认证中心签订《检查合同》。 初审：分中心对申请者材料进行初审，对申请者进行综合审查。
4、实地检查评估：认证中心在确认申请者交纳颁证所需的各项费用后，派出有资质的检查员进行实地检查评估。
5、编写检查报告：检查员完成检查后，按认证中心要求编写检查报告。
6、综合审查评估意见：认证中心根据申请人提供的申请表、调查表等相关材料以及检查员的检查报告和样品检验报告等进行综合审查评估，编制颁证评估表。